I Tomtar & troll – Den hemliga kammaren får vi bekanta oss med tonårstomten Junior och hans far chefstomten Jalle. När de ska hjälpas åt att dela ut djurens matransoner inför vintern upptäcker de till sin fasa att maten är stulen från deras hemliga förråd.Bakom stölden ligger trollbröderna Fejs och Sluggo som verkställt sin elake far Fassas plan. Junior och hans bäste vän Smygis ger sig iväg för att återerövra den välbehövliga maten. Det blir ett äventyr som tar dem längst in i den djupa trollgrottan.